Метка: узловые гены

Цель Аллергический ринит (АР) относится к форме воспаления дыхательных путей, которое в основном поражает слизистую оболочку носа и придаточных пазух. Целью данного исследования было изучение уровня инфильтрации иммунных клеток и патогенеза АР. Методы Мы провели всесторонний анализ двух профилей экспрессии генов (GSE50223 и GSE50101, всего 30 пациентов с АР и 31 пациентов группы контроля). для оценки уровней инфильтрации иммунных клеток использовали алгоритм CIBERSORT (прим.экспертов  – CIBERSORT — это аналитический инструмент, созданный лабораториями Ализаде и Лабораторией Ньюмана для определения профилей экспрессии генов и оценки распространенности типов клеток в смешанной клеточной популяции с использованием данных об экспрессии генов). Для изучения потенциальных генов или генных модулей, связанных с иммунным статусом, был применен анализ сети взвешенной коэкспрессии генов. Анализ обогащения набора генов и анализ вариаций набора генов были выполнены для изучения потенциальных механизмов АР. Сеть белок-белковых взаимодействий была построена для исследования узловых генов, также была проведена консенсусная кластеризация для идентификации молекулярных подтипов АР. Результаты По сравнению с группой контроля, у пациентов с АР были высокие уровни содержания и процент CD4+ Т-клеток, активируемых памятью. Было идентифицировано сто восемь дифференциально экспрессируемых генов, связанных с иммунитетом. Анализ обогащения по функциональной принадлежности показал, что АР в основном связан с межклеточной адгезией лейкоцитов, взаимодействием цитокин-цитокиновых рецепторов, активацией Т-клеток и […]